經過為期三年的考古發掘，重慶老鼓樓衙署遺址清理各類遺跡２６１個，出土文物標本９０００余件（套）。
重慶市文物考古所介紹，經過為期三年的考古發掘，發掘面積１２６４０平方米，發現、清理各類遺跡共計２６１個，出土了一批保存較好的陶瓷器、錢幣、瓦當、礌石等標本９０００余件（套），跨宋元、明、清、近現代四個時期，基本廓清該遺址情況，取得了重大發現。２０１３年，老鼓樓衙署遺址成功入選“２０１２年度全國十大考古新發現”和第七批全國重點文物保護單位，評選專家充分肯定了遺址的重要價值和考古發掘工作，指出老鼓樓衙署遺址見證了重慶千年的沿革變遷，是重慶市已發現的等級最高、價值最大的歷史建筑遺存，填補了重慶及西南地區城市考古的重大空白，對于研究中國都城以外的地方衙署資料具有重要意義。
目前，老鼓樓衙署遺址保護工作正有序推進，初步整理宋元時期遺跡資料２０余個，拼對修復了遺址出土標本１０００余件，完成了《重慶渝中區老鼓樓衙署遺址A區排水工程施工方案》《重慶渝中區老鼓樓衙署遺址高臺建筑基址保護修繕及防風化補強施工方案》《重慶渝中區老鼓樓衙署遺址高臺建筑基址表面清理施工方案》《重慶渝中區老鼓樓遺址BC區回填保護處理方案》等文物保護方案，并通過專家審核。
據悉，重慶市將繼續推進老鼓樓衙署遺址的保護、展示工作，結合新發現的太平門、順城街城墻及人民公園擴容，編制老鼓樓衙署遺址考古公園規劃。
重慶老鼓樓衙署遺址是抗蒙山城體系締造者——南宋兵部侍郎余玠的帥府所在地，是重慶主城區內發現的等級最高、價值最大的宋代建筑遺存。余玠當時就是在此命四川諸郡擇險筑城，建、擴２０多座城，特別是統率十萬軍民到合州修筑釣魚城，成為以后抗蒙的軍事中心。