其實，在三年行動計劃投入的14.4億元中，所占比例最大的就是工業廢水治理和重金屬污染防治項目，幾乎占到資金量的一半，而在這部分資金中由企業自籌的達到80%，中、省和市、縣配套各占10%，企業水污染防治資金能否按照項目要求落實到位成為這次計劃成敗的關鍵。
為此，商洛制定了全市丹江等流域污染防治工作考核辦法和問責機制，逐級落實責任，將水質目標落實到每一條支流、每一個轄區、每一個斷面，把治污措施和防治項目落實到各污染點源、排污單位和具體責任人。今后哪個縣區行政區域內出了環境污染事故，就是哪個縣區的責任，縣區主要領導就得承擔責任，接受責任追究。
除此之外，商洛今后要嚴把新建項目環評、審批、準入關口，杜絕邊治理、邊上落后項目、邊污染的現象發生。改造升級和新建一批水質監測點，監督丹江等主要河流流經各區縣的水質情況，凡在本區域內污染加重的，嚴格落實黃牌警告、考核扣分和行政問責措施，對一年內仍在污染丹江、屢禁不止的企業，依法堅決予以停產、關閉。
讓環保從城鎮延伸到鄉村
在完成縣縣建成污水處理廠和垃圾處理場的目標之后，商洛市下一步將目光投向了重點鎮和農村社區及新建的工業園區及大型住宅小區，三年內要改變目前“垃圾靠風刮、污水靠蒸發”的狀態。
三年計劃中明確，對已建成的污水處理廠，要加快管網建設，提高管網覆蓋面和污水收集率。對于重點鎮、農村社區和工業園區、大型住宅區，要充分考慮污水管網設施和處理設施，做到同步規劃、同步實施。同時，按照“村收集、鎮轉運、縣處理”的方式，構建高效有序的農村垃圾處理系統，突出對丹江沿岸小溝渠、支流小溪周邊的村莊以及城鄉接合部的生活污染進行整治，有效解決農村環境臟、亂、差的問題。
農業面源污染也是水源區主要污染因素之一。商洛市的面源污染主要來自于水土流失、化肥流失、農村生活污水及固體廢棄物、畜禽養殖污水等方面。為此，商洛把加強農業面源污染治理放在更加突出的位置，開展農業面源污染監測預警，調整農業產業結構，轉變農業生產方式，大力發展生態農業、循環農業。在種植方面大力推廣配方施肥、化肥深施、施用有機肥等肥料合理使用技術，推廣選用高效、低毒、低殘留農藥和生物農藥，防止化肥、農藥的不合理使用。與此同時，積極普及農村沼氣，加快沼氣工程建設，推進秸稈、人畜糞便、生活垃圾和污水的資源化利用，努力實現清潔田園、清潔家園目標。