除了皇宮布局，就連皇宮有多少個門、城門設置、名字也都一樣。“比如午門。午門的叫法是朱元璋開創的，以明故宮為開始，之后皇城的正南門都叫午門。”楊國慶說。
《明太宗實錄》上也記載：“(北京故宮)凡廟社、郊祀、壇場、宮殿、門闕，規制悉如南京明故宮 ，而高敞壯麗過之。”
面積
南京明故宮大
那么，皇宮的面積、大小是否也要統一呢？不論600年前，明故宮多么雄偉，現在都已經頹廢不堪了，似乎和北京故宮沒什么好比的。那利瑪竇的話如何驗證呢？
在微博上，現代快報記者做了一個調查：究竟是明故宮大還是北京故宮大？答案各不相同，有的說一樣大；有的說，當然是北京故宮大；但更多支持南京明故宮更大一些。還有一些人說：“不好說，要實地測量了才知道呢。”
楊國慶說，人們說的明故宮是一種口頭稱呼，其實是明朝的皇宮，是皇城和宮城的合稱。那么，究竟是哪個更大呢？“目前權威部門公布的北京故宮占地面積是72萬平方米。而《南京明故宮遺址保護總體規劃(2012~2032)》方案上顯示，南京明故宮遺址保護范圍總面積為101.25公頃，約比北京故宮整整大出28萬平方米。”馬渭源說。
前后花了20多年的時間才最終建成的明故宮，絕非今天的明故宮遺址公園那一小塊。這些年，通過地下考古，考古人員已經找到了南京明故宮的三界，北界在北安門，南界瑞金路，西界城東干道，現在就皇城東界還沒有找到。有人說，明故宮是中世紀世界上最大的宮殿。
皇城周長
北京故宮略微長一些
有趣的是，從皇城的周長來看，又恰恰顯示了相反的結果。
據楊國慶介紹，南京明故宮宮城長度為3.4505公里，平面呈長方形，南北城墻長0.755804公里，東西城墻長0.96944公里；明故宮皇城在朱元璋時期的長度是8.23008公里，永樂三年，朱棣把西邊城墻進行了擴建，長度增加了兩公里，變成了10.23008公里。那么北京故宮的長度如何呢？據顯示，北京故宮皇城是長方形的，南北城墻長3公里，東西長2.5公里……“北京皇城的長度要稍微長一點點，長了700多米。”楊國慶說。
這樣不同的答案真讓人暈乎，究竟哪一組數字更準確。
但楊國慶說，其實好理解，雖然南京明故宮是母本，但朱棣照搬的是規制，并不是大小。朱元璋建皇宮的時候，國力還不是那么雄厚，加上朱元璋本人是農民出身，皇宮相對小一些，可以解釋得過去。到了朱元璋的第四個兒子朱棣遷都北京，國力已經相當雄厚，加上朱元璋培養的能工巧匠們也被帶到了北京，所以，皇宮可能會更大一些。不過，他也認為，究竟哪個更大，還是要實地測量了才算。因為，資料常常會不準確。
金鑾殿
北京太和殿大，還是南京奉天殿大？
在北京故宮，最大、最輝煌的宮殿要屬太和殿。太和殿是清朝以后才有的名字，明朝時候也叫奉天殿。太和殿就是我們俗稱的皇帝的金鑾寶殿，在平時是不使用的。據記載，明清兩朝皇帝只在即位、大婚、冊立皇后、命將出征，以及每年元旦、冬至、石壽節，也就是皇帝生日三大節的時候，才會使用，而且，都要在這里舉行隆重的朝會典禮。
北京故宮的太和殿，坐落在全部用漢白玉雕砌的三重臺基上。太和殿，為什么要建在臺基上呢？太和殿的臺基又為什么不是一重呢？早在春秋戰國時候，宮殿建筑的時尚是把房屋建在夯土臺上，一來少受地下潮氣的侵蝕，同時，外觀宏偉，居高臨下，能顯示皇宮的威嚴。整個大殿占地2300多平方米，一把雕龍鎦金大椅高擱于七層階梯的臺上，這就是皇帝的寶座。