為何此次襲擊事件會發生在云南，在當地引發多種猜想。由于云南背靠東南亞毒品產地的特殊地理位置，以及長期與毒品貿易艱苦斗爭的現實，不少猜測都與毒品貿易有關。而毒品貿易與暴力恐怖行為到底有多大的關聯度，引發關注。
一個廣為流傳的巧合是，3月1日昆明火車站暴恐事件發生之日，正好是一年前緬甸販毒頭目糯康被中方執行死刑一周年。有民間猜測認為，或有糯康勢力的殘余為了報復，出錢；暴力恐怖分子為了極端宗教目的出人，共同實施暴力襲擊的可能。
但這一猜測至今并無直接證據能夠證實。記者向來往緬甸以及中緬邊境的相關人士多方打聽，均未獲得可靠證據。有長期關注緬甸的人士認為，在湄公河和金三角地區，糯康的能量本來就有限。很難想象在他死后一年，還會有人幫他報仇。
而案發后，大陸媒體財新網的報道則顯示了此次暴力恐怖襲擊事件，或與此前就在云南生活的某些維吾爾族人有關聯，這同樣引發與毒品有關的猜測。
據該大陸媒體引用當地“接近警方的消息人士”的話稱，8名襲擊者中的3名外圍接應人員“曾在昆明有過案底，他們曾因打架被警方拘留過，并且留有指紋等信息。此次事件發生后，警方曾進行過指紋對比。”
云南省公安人士向《鳳凰周刊》介紹，從上世紀末起，來自新疆的維吾爾族人士逐步進入云南謀生。其中不少已經融入當地社會，穩定生活。生活在大理的維吾爾族烤肉店店主阿布都得到當地不少漢族朋友的幫助，就成為昆明襲擊事件之后廣為流傳的和諧“正能量”。阿布都的店門口，貼著朋友們用漢字寫的大海報，呼吁大家善待阿布都，以區分普通維吾爾族民眾和少數極端分子。
“他們大部分都以賣烤肉、果干及穆斯林食品為生，個別的開設了一些小飯店。”
上述公安人士介紹，“但隨著時間推移，也有少數人是以街頭盜竊為生，其中未成年人占了很大比例，但他們多為被犯罪團伙脅持，社會成因復雜。”
該公安人士透露，一個值得注意的現象是，還有一些人長期待在云南，經常往返新疆與云南之間。調查顯示，這部分人沒有明顯的穩定的職業或收入來源，但經濟實力和消費能力都很強。其中不少被懷疑與毒品貿易有關。
“這些人不僅僅在昆明這樣的大城市活動，事實上在與緬甸接壤的邊境地區也很多，例如瑞麗、景洪等邊境城市里隨時可以看見他們的身影。”上述人士透露。
從云南省各部門近十幾年來破獲的毒品案件可見，涉及其中的新疆籍或維吾爾族人士屢見不鮮。眾所周知，從緬甸、老撾和泰國等東南亞國家進入云南省的毒品一直無法杜絕，而這些毒品中的一部分最終被販賣到了包括新疆在內的西北地區，在攜帶、運輸的違法犯罪人員中，也屢屢出現維吾爾族人的身影。
“毒品利益的情況很復雜，本來靠近新疆的阿富汗便是毒品種植地和泛濫區，理論上應該是毒品從那些地區進入新疆及大陸腹地。”匿名云南稽毒人員告訴《鳳凰周刊》，“但是長期以來，新疆的一些販毒人員仍然不斷來到云南，購買、販運緬甸和金三角地區生產的毒品，其中的原因值得深究。究竟是價格問題，還是毒品質量問題吸引了這些人的冒險？我們一直都在留意。”
盡管維吾爾族人士只是在云南涉及毒品貿易的群體中的一小部分，但仍有一些引起注意的特別現象。
“那些參與販毒的維吾爾族人很值得研究，他們都非常聽老板的話，也非常守紀律。”西雙版納的一名知情人士介紹，“金三角地區一些販毒組織很喜歡和維吾爾族人交易，合作長了覺得他們很爽快，也不隨便出賣人。他們多年來已經形成固定的利益關系，一些維吾爾族人把金三角的毒品不斷販運到了西北地區。”