11月27日記者獲悉，上海交通大學(xué)醫(yī)學(xué)院附屬仁濟(jì)醫(yī)院消化科研究員陳豪燕和研究員洪潔團(tuán)隊(duì)，首次揭示了腸道真菌具有預(yù)測腫瘤免疫治療療效的作用，且腸道真菌預(yù)測準(zhǔn)確性較細(xì)菌更高。該研究為篩選腫瘤免疫治療的應(yīng)答者及提高免疫治療的適用性提供了新思路。研究成果日前在線發(fā)表于《細(xì)胞》子刊《細(xì)胞·宿主與微生物》。
腫瘤免疫檢查點(diǎn)抑制劑（ICB）的研發(fā)是癌癥治療的重大突破。然而，只有一小部分癌癥患者對ICB治療有應(yīng)答反應(yīng)。近年來，越來越多的研究表明，腸道菌群結(jié)構(gòu)能影響癌癥患者使用ICB的有效性。然而，人體腸道菌群的構(gòu)成主要由飲食和生活方式?jīng)Q定，不同地區(qū)或人種間的腸道菌群構(gòu)成存在明顯差異。因此，先前研究中與ICB療效相關(guān)的腸道菌群特征結(jié)果并不一致。
為了解決這個(gè)問題，有學(xué)者對相關(guān)研究進(jìn)行了整合分析，以確定在不同研究中普遍存在的能預(yù)測ICB應(yīng)答的細(xì)菌，并對細(xì)菌的預(yù)測性能進(jìn)行了評估。然而，腸道細(xì)菌的預(yù)測效果并不令人滿意。
真菌是人類腸道微生物群中不可或缺的一部分，在塑造宿主免疫和維持腸道內(nèi)穩(wěn)態(tài)方面起著至關(guān)重要的作用。但腸道真菌與ICB應(yīng)答的關(guān)系目前尚不清楚。
此項(xiàng)研究整合了來自不同國家、不同腫瘤類型的使用ICB治療的患者的9個(gè)宏基因組隊(duì)列，同時(shí)計(jì)算了腸道真菌及細(xì)菌雙界微生物組豐度，發(fā)現(xiàn)了可用于預(yù)測ICB治療應(yīng)答的真菌及細(xì)菌標(biāo)志物。研究團(tuán)隊(duì)通過構(gòu)建隨機(jī)森林模型，預(yù)測癌癥患者對ICB的應(yīng)答反應(yīng)。
結(jié)果顯示，腸道真菌具有良好的預(yù)測效能且其預(yù)測效能比細(xì)菌更高。此外，整合細(xì)菌及真菌雙界標(biāo)志物進(jìn)行預(yù)測時(shí)會達(dá)到最好的預(yù)測效能。根據(jù)真菌標(biāo)志物預(yù)測的ICB治療的應(yīng)答者，其腫瘤免疫微環(huán)境中有更多的耗竭性T細(xì)胞浸潤，且該類患者的生存期優(yōu)于不應(yīng)答者。雙界網(wǎng)絡(luò)分析及微生物功能預(yù)測分析表明，真菌能在應(yīng)答者腸道中將淀粉發(fā)酵成短鏈脂肪酸，從而促進(jìn)ICB治療的應(yīng)答。
“這項(xiàng)研究首次揭示了ICB治療的應(yīng)答者及不應(yīng)答者全面的泛癌腸道真菌譜，發(fā)現(xiàn)了具有良好預(yù)測性能的雙界微生物標(biāo)記物，突出了真菌在預(yù)測免疫治療療效方面的潛力，有望提高ICB治療的適用性，為利用雙界微生物標(biāo)記物預(yù)測ICB療效、改善應(yīng)答提供新思路。”陳豪燕認(rèn)為。（記者王春）